那部动漫也是描写哥斯拉的，而基多拉在这部动漫中又是作为哥斯拉的大敌登场。
可登场的那头基多拉很不一般，它并非和哥斯拉在同一时空，而是接受到艾克西夫人召唤后，跨越时空降临，与哥斯拉大战！
艾克西夫人梅德菲斯召唤那头基多拉降临时，他的眼睛就变成了现在基多拉、凯撒基多拉们眼睛一样的形态，眼中一张金色线条交织的，的中心闪烁着一颗明亮的金色圆点。
这种形态的眼睛其实是在为跨时空降临的基多拉提供视野，毕竟它真身并不存在这个宇宙，想要观察这个宇宙，需要有人作为它的眼睛。
在动漫中，艾克西夫人梅德菲斯作为基多拉跨越时空的眼睛，而现在，黄翔基地中所有的基多拉和凯撒基多拉便是这头即将跨越时空降临的基多拉眼睛。
“难道有一头基多拉在跨时空降临？”
黄翔想到这里，心里冒出这么一个想法，他马上下令杀掉所有基多拉，想要阻止这头能跨越时空的基多拉降临。
虽然在动漫中，失去了跨时空能力的基多拉似乎是只弱鸡，被动漫里的哥斯拉轻易打败了，但那头哥斯拉可不是一般品种啊，生长了两万多年，让地球的生态环境都为它而适应，黄翔可不确定自己是否能干得过这头跨时空降临的基多拉。
然而，在黄翔下这个决定时，已经晚了！
黄翔忽然感受到整颗地球在震动，似乎有什么恐怖的力量连地球都撼动了，黄翔布置在各地的观测仪器向他传来报告，让他知道发生了什么。
整个地球的引力场发生了异常！
不，不是地球的引力场异常，而是整个太阳系的引力场都发生了异常！
若是从太空俯瞰整个太阳系，如果能肉眼观察到引力场的话，定会看到，在太阳系上方的宇宙真空中，扭曲的力量以一个点开始向着四周传递，这股力量所传到处，空间皆被扭曲，正是它造成了整个太阳系的引力场异常。
这股力量越来越强，初始被扭曲的那个奇点已经不是点了，而成了一个时空通道，而且这个通道还在不停扩大，其所造成的引力场异常影响也越来越大。
黄翔布置在太空中的仪器探测到了引力场异常，却无法观测到有什么东西出现，但他明白这是一头非常恐怖的基多拉正在降临！
基地中的基多拉和凯撒基多拉，在黄翔的命令下，快速被屠杀干净，所有的基多拉都已被摧毁双眼，可这降临的趋势一点也没改，似乎这一头基多拉的降临并不需要眼睛继续为它引导。
“这不可能啊！”
黄翔观测到引力场的异常没有减弱，反倒越来越强，心中有些惊讶，怎么没有阻止得了这头基多拉降临？
但他也没空多想，立刻命令所有黑洞炮向着太空中那片空间扭曲、引力异常的区域开炮。
黑洞炮能扭曲时空，或许黑洞炮能对这头基多拉造成一些伤害，将它打回去。
可惜让黄翔失望了！
黑洞炮所发射的黑洞，根本没能轰到那边区域。
因为那片区域附近的引力太强，空间已被完全扭曲，黑洞炮发射的黑洞还没到达，就已被摧毁。
这呆不下去了，得赶紧跑路，再不跑，说不定就跑不了了！
黄翔倒也十分果决，即刻让黑洞炮轰炸骷髅岛，他打算将骷髅岛地底的虫洞轰塌，造成时空崩溃，他好浑水摸鱼，从崩溃后的时空乱流里逃走。